INF4350 – Grunnkurs i bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Timeplan, pensum og eksamensdato
Kort om emnet
Emnet gir en innf?ring i sentrale begreper og metoder innen bioinformatikk. Det vil v?re lagt vekt p? gjennomgang av effektive algoritmer og teknikker som benyttes i aktuelle programmer for analyse av genetiske sekvenser. Temaer som behandles vil v?re: sammenligning og sammenstilling av to eller flere sekvenser, indeksering av og s?king i sekvensdatabaser, m?nsteroppdaging, s?king med sekvensm?nstre, genprediksjon, samt mapping og "assembly" av data fra genomsekvensering. Element?r kunnskap i molekyl?rbiologi vil bli formidlet underveis.
Hva l?rer du?
Etter ? ha tatt INF4350:
- forst?r du grunnleggende begreper i bioinformatikk
- har du oversikt over noen av de viktigste metodene og verkt?yene som benyttes
- forst?r du hvordan noen av de grunnleggende metodene for analyse av biologiske sekvenser fungerer
- forst?r du behovet for at metodene er n?yaktige og effektive
- kan du implementere noen av algoritmene
- kan du utf?re enkle sekvensanalyser ved ? anvende eksisterende verkt?y
Opptak og adgangsregulering
Studenter m? hvert semester s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke opptak til v?re studieprogrammer, eller s?ke om ? bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Anbefalte forkunnskaper
Emnet bygger p? INF1000 – Grunnkurs i objektorientert programmering (videref?rt)
Overlappende emner
- 9 studiepoeng overlapp mot INF325
- 10 studiepoeng overlapp mot INF2300 – Grunnkurs i bioinformatikk (nedlagt)
- 10 studiepoeng overlapp mot INF3350 – Grunnkurs i bioinformatikk (nedlagt)
- 10 studiepoeng overlapp mot INF5330 – Bioinformatikk (nedlagt)
Undervisning
2 timer forelesning og 2 timer gruppe?velser per uke.
Eksamen
Karakter vil bli gitt p? grunnlag av 2 deleksamener som teller 15% hver, og en avsluttende 4 timers skriftlig digital eksamen som teller 70%. Strykkarakter p? en deleksamen gir likevel mulighet til ? g? opp til de resterende eksamenene. Alle eksamener m? gjennomf?res i samme semester.
Hjelpemidler
Ingen hjelpemidler er tillatt.
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.
Begrunnelse og klage
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Studenter som dokumenterer gyldig frav?r fra ordin?r eksamen, kan ta utsatt eksamen i starten av neste semester.
Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordin?r eksamen, eller som ikke har best?tt.
Trekk fra eksamen
Det er mulig ? ta eksamen i emnet inntil tre ganger. Dersom du trekker deg fra eksamen etter fristen eller under eksamen, bruker du et eksamensfors?k.
Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emner: INF325.
Annet
Det er sterkt anbefalt ? m?te p? f?rste forelesning fordi det vil bli gitt viktig informasjon.