INF3340 – Statistiske metoder i bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Timeplan, pensum og eksamensdato
Kort om emnet
Emnet gir en innf?ring i statistiske metoder brukt innen bioinformatikk. F?rste halvdel av kurset vil legge vekt p? grunnleggende begreper innen statistikk som sannsynlighetsfordelinger, Markovkjeder og hypotesetesting med eksempler fra bioinformatikk. Andre halvdel av kurset vil se p? anvendelse av statistikk innen sekvensanalyse, herunder m?nstergjenkjenning i sekvenser og sammenstilling av sekvenser. Til slutt vil vi se p? regresjon og statistiske metoder anvendt innen analyse av ekspresjonsdata.
Hva l?rer du?
Emnet gir en innf?ring i utvalgte sentrale begreper i statistikk og gir et solid byggverk for videre forskning innen bioinformatikk. ?vingene i kurset vil v?re b?de teoretiske og praktiske. De praktiske ?vingene vil ha som hensikt ? l?re ? programmere innen den statistiske programpakken R.
Opptak og adgangsregulering
Studenter m? hvert semester s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke opptak til v?re studieprogrammer, eller s?ke om ? bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Obligatoriske forkunnskaper
INF3350 – Grunnkurs i bioinformatikk (nedlagt) / INF4350 – Grunnkurs i bioinformatikk (videref?rt)/INF2300 – Grunnkurs i bioinformatikk (nedlagt)/INF5330 – Bioinformatikk (nedlagt) og INF1010 – Objektorientert programmering (videref?rt) /INF 101
Anbefalte forkunnskaper
INF1020 – Algoritmer og datastrukturer (nedlagt), STK1000 – Innf?ring i anvendt statistikk / STK1100 – Sannsynlighetsregning og statistisk modellering.
Overlappende emner
10 sp mot INF4340 – Statistiske metoder i bioinformatikk (nedlagt), 10 sp mot INF9340.
Undervisning
2 timer forelesning og 2 timer gruppe?vinger hver uke. Det kreves gjennomf?ring av to obligatoriske oppgaver som m? v?re best?tt for ? g? opp til eksamen.
Eksamen
Muntlig eksamen. Bokstavkarakter (A - F).
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Dette emnet tilbyr ikke ny eksamen i begynnelsen av p?f?lgende semester til kandidater som stryker eller trekker seg under ordin?r eksamen. For generelle opplysninger om ny og utsatt eksamen, se /studier/admin/eksamen/sykdom-utsatt/mn/index.html
Annet
Det er obligatorisk oppm?te p? f?rste forelesning.
Tilsynssensor for emnet er: Lars Snipen