KJM9350 – Proteinkrystallografi
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
KJM9350 gir en grundig innf?ring i proteinkrystallografi, den sentrale teknikken for strukturbestemmelse av proteiner og biomolekyl?re komplekser. Teknikken vil bli undervist i teori og praksis, og vil gi et godt grunnlag for en PhD-oppgave innen fagomr?det. Emnet skal ogs? sette kursdeltagerne istand til ? forst? og kunne vurdere moderne forskningslitteratur innen fagfeltet.
Hva l?rer du?
Etter ? ha fullf?rt emnet:
- har du fundamental forst?else av proteinkrystallografi
- kjenner du til viktige fagbegreper og konsepter som symmetri, romgrupper, krystaller og krystallisering, diffraksjon, Braggs lov, faseproblemet, Fouriersyntese og Fourieranalyse, strukturl?sning ved multiple isomorphous replacement (MIR), multiple anomalous dispersion (MAD) og molecular replacement (MR), Pattersonfunksjon, Pattersonkart og elektrontetthetskart, raffinering og validering
- har du praktiske ferdigheter i strukturbestemmelse av proteiner med r?ntgendiffraksjon
- f?r du innsikt i andre eksperimentelle metoder for 3D-strukturbestemmelse av makromolekyler som kryo-elektronmikroskopi (kryo-EM) og kjernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi
- kan du utf?re relevante databases?k
- kan du lese, forst? og vurdere en krystallografisk artikkel
Opptak til emnet
Ph.d.-kandidater ved UiO s?ker plass p? undervisningen og melder seg til eksamen i?Studentweb.
Hvis emnet har begrenset kapasitet, vil ph.d.-kandidater som har emnet i sin utdanningsplan ved UiO bli prioritert. Noen nasjonale forskerskoler kan ha egne regler for rangering av s?kere til emner med begrenset kapasitet.
Ph.d.-kandidater som har opptak ved andre utdanningsinstitusjoner m? innen angitt frist?s?ke om hospitantplass.
Anbefalte forkunnskaper
Det er en fordel ? ha noe kunnskap om proteiner og grunnlegende matematiske kunnskaper.
Overlappende emner
- 10 studiepoeng overlapp med KJM4350 – Proteinkrystallografi.
- 10 studiepoeng overlapp med KJM3350 – Proteinkrystallografi (nedlagt).
Undervisning
Emnet g?r over et semester. Undervisningen best?r av:
- 27 timer forelesninger
- 30 timer obligatoriske regne?velser og diskusjonskollokvier
- 8 timer obligatoriske laboratorie?velser, og
- en obligatorisk litteraturoppgave som studentene m? b?de presentere muntlig og levere inn skriftlig
For ? kunne g? opp til eksamen, m? du ha v?rt til stede p? alle obligatoriske aktiviteter, og laboratoriekurset (inklusive maksimalt 2 siders rapport) og litteraturoppgaven m? v?re godkjent.
I utgangspunktet skal alle obligatoriske oppgaver innleveres, men det er tillat ? droppe én av f?lgende oppgaver: Patterson-?velse, labrapport eller skriftlig innlevering av litteraturoppgave.
Et fullf?rt og godkjent laboratoriekurs er gyldig i seks semestre utover det semesteret det ble godkjent. Etter denne perioden m? du gjennomf?re laboratoriekurset p? nytt for ? kunne fremstille deg til eksamen.
Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning. Du mister plassen p? emnet dersom gyldig forfall til f?rste forelesning ikke er meldt til Kjemisk institutts f?r forelesningen starter.
Laboratorieundervisningen er obligatorisk og m? v?re godkjent f?r du kan g? opp til eksamen. Frav?r m? dokumenteres med legeerkl?ring eller tilsvarende.
Eksamen
- Avsluttende muntlig eksamen som teller 100 % ved sensurering.
For ? g? opp til eksamen m? du ha deltatt p? alle obligatoriske aktiviteter, og laboratoriekurset og litteraturoppgaven m? v?re godkjent.
Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emner: KJM4350 – Proteinkrystallografi
Hjelpemidler til eksamen
Ingen hjelpemiddel er tillatt
Eksamensspr?k
Du kan ta eksamen p? Skandinavisk spr?k eller p? engels
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala best?tt/ikke best?tt. Les mer om karakterskalaen.
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Det arrangeres?utsatt eksamen?i starten av neste semester for studenter som dokumenterer gyldig frav?r fra ordin?r eksamen.
Det arrangeres?ny eksamen?for studenter som ikke best?r ordin?r eksamen.
Studenter som trekker seg under eksamen blir ikke tilbudt ny eksamen.
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Tilrettelegging p? eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk p? eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen p? nytt
- Fusk/fors?k p? fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.