Sommerinfo 2014

Hei TSD brukere

Denne informasjonen gikk til alle som er registrerte brukere av TSD (og noen f? som burde registrere seg ganske raskt).

Systemkrasj :
Vi hadde en systemkrasj for 2 uker siden. Det var antageligvis en annen tjeneste ved USIT som overlastet v?r gateway og drepte den, men vi vet ikke sikkert. I perioden f?r krasjet var det mye som ikke fungerte i TSD grunnet TCP- (data-) pakker p? avveie. Dette medf?rte at vi m?tte sette opp v?r backupl?sning og endre adresse p? gateway. For dere med windows m? putty-konfigurasjonen endres der det st?r host til jh.tsd.usit.no, for dere med linux m? dere oppdatere yum pakken tsd-client. Se her for mer info : http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/hjelp/brukermanual/


Prosjektstatus :
- Alle innrapporterte prosjekts?knader og s?knader om ? bli bruker i TSD er ajour av 3/7-14, brukernavn og passord kan hentes etter avtale
- Sjekk prosjektstatus p? : http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/mer-om/kunder/index.html
- Det er mange prosjekt som har meldt inn brukere som ikke har registrert seg selv. Prosjektledere m? s?rge for at deres medarbeidere registrerer seg her : https://nettskjema.uio.no/answer/52956.html
- Vi ber om at brukere registrerer seg for prosjektene p14 (Typisk norsk), p16 (addisons), p17 (episeq), p20 (tumorbiologi), p45 (Jonas K Buer).

Prosjekts?knad :
Papirm?llen for UIO prosjekt har blitt forminsket til kun ett skjema. Derfor ?nsker vi ikke nye samleavtaler med institutt / fakultet ved UIO internt.
Se : http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/aktuelt/enklere-prosjektregistrering-ved-uio.html

Filslusen :
- Vi har opplevd en del kr?ll med filslusen, dette skal ha blitt l?st med siste detaljer i dag morges,  slusen har n? f?tt en overhaling og st?tter n? ogs? import av kataloger
NB0 : Filslusen st?tter fremdeles ikke norske spesialtegn eller blanke i filnavnene (pakk filer f?r import/export s? slipper du dette)
NB1 : Filslusen er en komplisert teknisk implementasjon og vi ?nsker at dere er flinke til ? pakke sammen og komprimere filer s? mye som mulig f?r import og eksport. Komprimerte filer vil ogs? importeres raskere. Vi har opplevd at to brukere kopierer inn samme fil samtidig og derved krasjer systemet.
NB2 : For de som bruker Filezilla m? man huske at ved export, om det ser ut til at filen ikke er eksportert, trykk F5 mens Filezilla vinduet er aktivt for en "force-update" av fillisten
NB3 : Husk ? rydd opp p? fx01/pXX/import etter man har plukket opp filene sine fra innsiden, og husk ? rydd opp pXX/fx/export n?r man har plukket opp filer fra utsiden. Filer som ligger her vil fylle opp diskene og ?delegge for andre (diskplass og overf?ringshastighet). Vi jobber med ? automatisere dette med sletting av originalfil 24t etter import og eksport.

Nettskjema :
Nettskjema skal n? automatisk havne i prosjektet fx/import/sns/<keyID/<NettskjemaID> og kan plukkes opp der og dekrypteres.  (keyID = id til kryperingsn?kkel som ble brukt i ditt prosjektet)
Dette fungerer og PGP n?kler er p? plass for p26, p32, p36, p38 og p44
Mer info om dette p? http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/hjelp/secure-nettskjema/
(Si ifra om dere oppdager at skjema ikke kommer inn, vi har misstanker om noen barnesykdommer. Men skjemaer blir ikke borte!!)
Nettskjema vil i l?pet av h?sten oppgraderes til niv? 4 mtp autentisering i ID-porten. Man kan da ikke lenger bruke minID, men m? bruke bankID eller comfides / buypass for ? logge inn, dette i samsvar med ?nsker indikert i "Normen".

HPC :
Colossus er i full drift. De prosjektene som har s?kt om ? f? bruker Colossus er klart for dette, men pga ferie har vi ikke f?tt oppdatert kvotene for p43 , p46, p47 og p49. Disse prosjektene kan derfor ikke kj?re jobber enda. Vi er i ferd med ? f? laget brukerinfo for dette, men dere som kjenner Abel vil kunne bruke Colossus nesten helt likt med Abel.
Kvoter og brukerinfo er/kommer her : http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/hjelp/hpc-usage/  (oppdateres med mer brukerinfo i morgen), her ser man ogs? hvem som kan bruke Colossus pr i dag.
Nesten all software p? Colossus finnes tilgjengelig inne i TSD (se http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/hjelp/programvare/index.html), som oftest med make-script, dette kan du hente ned til din VM ? installere etter behov.

Software :
All software som har blitt lovet i TSD er p? plass, med unntak av lisensserveren for SPSS (h?per ? f? det p? plass innen folk starter til h?sten igjen)
Noe software kan kun kj?res av brukere fra UIO (Matlab, Stata-SE mm,) om du ikke er ved UIO og trenger dette m? dere ta kontakt med tsd-drift@usit.uio.no s? skal vi se hva vi kan f? til
All software som finnes p? Colossus (dvs ogs? p? Abel) finnes tilgjengelig inne i TSD. Se : http://www.uio.no/tjenester/it/forskning/sensitiv/hjelp/programvare/index.html  (som oftest med make-script), dette kan du hente ned til din VM ? installere etter behov.

Databaser :
Vi har n? f?tt str?mlinjeformet bestilling av databaser i TSD og f?rste brukere rapporterer at det ser bra ut. p22, p38, p40 har pr n? databaser. Om det er ?nskelig med spesiell software for Postgres-kommuniksjon m? dere ta kontakt. P40 kan ogs? ta kontakt for username + pwd til db.

Virtuelle maskiner :
Om dere opplever disse som trege kan vi gi dem mer kraft (CPU / RAM). Store jobber b?r kj?res p? tungregneklyngen uansett, men vi kan gi en god del mer kraft til VM?er. Hvis det er store utvidelser som ?nskes vil dette faktureres ved periodeslutt.
NB : Vi opplever at linux-vm?er som rebootes av brukere selv av og til f?r kernel-panic, dette er litt knot ? fikse s? vennligst ikke reboot VM?er uten at det er et behov for det. Vi jobber med en permanent fix.

Prosjektspesifikk info :
p41 : importen deres hadde stagnert siden dere pr?vde ? importere 160GB til et omr?de p? 20GB (tilsynelatende st?rre, men 20Gb var faktisk str), omr?det har blitt utvidet (p41/fx/import) og nesten alt har kommet inn, men en del filer har ikke kommet inn pga norske tegn / blanke i filnavn
p34 : som nevnt sliter vi med USB disken dere kom med kopiering krasjer etter 610GB. F?lger opp etter sommeren.

Planlagt nedetid :
For ? fase inn v?r failover gateway i TSD etter krasjet, slik at vi har redundant gateway, m? vi ha to dager nedetid p? TSD i sommer. Dette vil antageligvis bli to p?f?lgende tirsdager eller torsdager i juli, med en ukes mellomrom. Man vil ikke kunne logge inn disse dagene, men maskinene deres og eventuell jobber vil kj?re (Colossus vil antageligvis krasje de jobbene som slutter i l?pet av nedetiden)
Vi kommer tilbake til dette p? denne epostlisten.

TSD generellt :
Vi har blitt mer popul?re enn vi trodde og m? legge om nettinfrastrukturen til ? takle flere enn 100 prosjekt. Dette kommer vi tilbake til. Ellers vil vi i l?pet av h?sten flytte de virtuelle maskinene over til VMware fra RHEV, vi h?per dere ikke vil f? noen nedetid. Vi vil starte med windows-prosjektene og f?lge p? med linux-prosjektene n?r VMware tilbyr et godt alternativ til dagens SPICE. Innlogging mot (s?rlig) linux maskiner vil bli enklere og plattformfritt n?r dette g?r i orden.
Videre vil TSD bli en tjenestegruppe ved USIT, ledet av Francesca Iozzi. Gard vil fortsatt v?re gruppeleder for 亚博娱乐官网_亚博pt手机客户端登录stjenester og dermed TSD, men prosjektet TSD vil avsluttes. Gard vil trekke seg litt tilbake fra daglig hands-on mtp brukerh?ndtering etc, og han vil v?re i pappaperm/ferie 18 juli- 8 desember (minus 2 uker jobb).
Ut over dette vil det bli flere ansatte i TSD milj?et fremover og vi jobber med ? ekspandere med Journalsystem for Psykolgisk institutt samt h?sting, god lagring og analyse av video i TSD sammen med UV/PSI og MedFak. Og til sist ser det ut til at USIT/TSD skal bist? Oslo Univ. Sykehus med ? v?re vertskap for klinisk dypsekvensering i et par ?r fremover.

Spennende tider !

Med ?nske om en god sommer og en enda bedre brukeropplevelse i TSD til h?sten.

Mvh
tsd@usit


PS : Det er viktig at dere bruker adressen tsd-drift@usit.uio.no for kommunikasjon med TSD, vi her her stort sett hele sommeren.

Published July 9, 2014 1:33 PM - Last modified July 9, 2014 1:34 PM