Systematikk og fylogeni hos fiskeparasitter i Oslofjorden - Masteroppgaver knyttet til forskningsprosjektet MonoMyx.

MonoMyx-prosjektet er finansiert av Artsdatabanken og ?nsker ? ?ke kunnskapen om biodiversiteten innen to grupper av parasitter p? fisk i Oslofjorden; Myxozoa og Monogenea. Disse to gruppene er sv?rt artsrike og lite studert generelt og spesielt gjelder dette for de som infiserer de s?rlige fiskeartene som forekommer i Oslofjorden. Oslofjorden er valgt som studieomr?de fordi det finnes et stort antall fiskearter der, mange som ikke finnes lengre nord. I tillegg er omr?det d?rlig unders?kt med hensyn p? disse parasittene. Det finnes helt sikkert ubeskrevne arter p? fisk i Oslofjorden.

I MonoMyx ?nsker vi ? unders?ke tilsammen 300 fisk for begge grupper av parasitter. Alle parasitter vil bli identifisert og bestemt morfologisk f?r de deretter blir DNA-strekkodet (DNA-sekvensering av egnede mark?rer). DNA-strekkoding vil bli gjort p? alle arter som er, eller antas ? v?re, nye for vitenskapen i tillegg til de som er nye registreringer for Norge. Arter som ikke er nye for Norge, men som det ikke finnes DNA-sekvenser for, vil ogs? bli strekkodet.

 

Mer info om MonoMyx-prosjektet hos Artsdatabanken

 

  • I forbindelse med MonoMyx-prosjektet og andre p?g?ende forskningsprosjekter kan vi tilby masteroppgaver med fokus p? problemstillinger innen systematikk, fylogeni, co-evolusjon for en rekke forskjellige vert-parasitt-systemer.
  • Prosjektet inneholder mange mulige problemstillinger og vert-parasitt-systemer som kan studeres. Innholdet og fokus kan tilpasses den enkelte studentens ?nsker.
  • Studentene vil l?re b?de molekyl?re og morfologiske teknikker i tillegg til feltarbeid og vil 亚博娱乐官网_亚博pt手机客户端登录e med forskere ved flere forskjellige institusjoner.
  • Metodikken for studere de fleste parasittene er tilgjengelig slik at oppgavene skal kunne gjennomf?res innen tidsfristen. Hvis studentene ?nsker kan det ogs? legges inn metodeutvikling.
  • Alle oppgavene vil planlegges slik at de skal resultere i en vitenskapelig publikasjon.

 

Veiledere: Haakon Hansen, Veterin?rinstituttet, Egil Karlsbakk, Havforskningsinstituttet og UiB,, Dag Klaveness, UiO.

 

Eksempler p? oppgaver/problemstillinger tilknyttet MonoMyx-prosjektet.

 

Monogenea

 

Gyrodactylus p? flatfisk (Pleuronectidae, Scopthalmidae, Soleidae).

  • Ukjent biodiversitet og nye arter?
  • Co-evolusjon eller host-switch? Sammenligne gyro-fylogeni og vertsfylogeni.

 

Genetisk diversitet innen slekten Calicotyle og arten Calicotyle kroeyeri hos nord?st-Atlantiske Rajidae.

  • Denne parasitten er funnet p? mange arter (euryxene), men det er gjort f? molekyl?rgenetiske studier.

 

Molekyl?r systematikk av Gyrodactylus-arter p? rognkjeks, Cyclopterus lumpus

  • Rognkjeks brukes i dag som rensefisk innen norsk lakseoppdrett og skal med dette bidra til ? bedre fiskehelse, men den er ogs? selv infisert av en rekke parasitter.
  • Parasitter i slekten Gyrodactylus er funnet p? rognkjeks i flere lokaliteter og vi har allerede pr?ver fra flere av disse lokalitetene.
  • Studenten vil sammenligne pr?ver fra flere lokaliteter vha. DNA-sekvensering og morfologi.

 

Diversitet innen Gyrodactylus hos Gobiidae (Pomatoschistus spp., Gobiusculus og Gobius).

  • En del er kjent, men sannsynligvis fortsatt mye ukjent.
  • Co-evolusjon eller host-switch?  Sammenligne gyro-fylogeni og vertsfylogeni.
  • Lett ? f? tak i materiale: strandnot

 

Co-evolusjon i slekten Diclidophora som infiserer torskefisk

  • Disse parasittene er antatt ? v?re vertsspesifikke, men molekyl?rt er lite gjort.
  • Co-evolusjonsstudier basert p? 28S ribosomalt og mitokondrielt COI.

 

Myxozoa:

 

Fylogeni innen familien Parvicapsulidae (Myxozoa)

  • I denne gruppen parasitter finner vi blant annet arter som skaper store problemer i norsk lakseoppdrett (se her for mer info).
  • Fylogenien til denne gruppene er ikke klarlagt og vi har materiale fra mange forskjellige arter og isolater tilgjengelig for dette studiet.
  • Studenten vil DNA sekvensere LSU (large subunit ribosomal DNA) fra isolater av artene i denne gruppen og utlede fylogenien basert p? dette.

 

Diversitet av slekten Chloromyxum i elasmobrancher.

 

Published Mar. 22, 2018 10:26 AM - Last modified Apr. 19, 2018 8:14 AM

Supervisor(s)

Scope (credits)

60