MBV4140 – Anvendt bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Emnet gir en innf?ring i databaser som er av interesse for molekyl?rbiologer; DNA- og proteinsekvensanalyse ved bruk av DOTBLOT, FASTA, BLAST; DNA-sekvensediting og contigkonstruksjon ved bruk av STADENpakken; En introduksjon til grunnleggende UNIX-kommandoer vil bli gitt slik at programmer i EMBoss-pakken, BLASTALL og andre kan brukes p? kommandolinjen .
Hva l?rer du?
Emnet skal gi kunnskap og forst?else til Web-basert verkt?y som er nyttig for molekyl?rbiologer. Dessuten vil du f? inng?ende kjennskap til noen av de mest brukte verkt?y. Du skal ogs? bli vant til ? bruke enkle UNIXkommandoer og vil f? bra kjennskap til de grunnleggende prinsipper og potensiell bruk av EMBoss.
Opptak og adgangsregulering
Studenter m? hvert semester s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke opptak til v?re studieprogrammer, eller s?ke om ? bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Anbefalte forkunnskaper
Du b?r ha god kjennskap til molekyl?rbiologiske prinsipper.
Overlappende emner
- 10 studiepoeng overlapp mot BIO355
- 3 studiepoeng overlapp mot KJB492
Undervisning
Det er usikkert n?r emnet undervises neste gang.
Emnet strekker seg over seks uker med 24 t. forelesninger og 48 t. praktiske oppgaver p? datamaskinen.
Eksamen
Prosjektoppgaver (50%) og skriftlig slutteksamen (50%). Bokstavkarakterer.
Emnet er valgfritt for studieretningene biokjemi og molekyl?rbiologi i masterprogrammet “Molekyl?rbiologi, biokjemi og fysiologi”