Pensum/l?ringskrav (INF4350 - H?st 2011) Jin Xiong: Essential Bioinformatics, 2006. Cambridge University Press. ISBN: 0-521-60082-0. chapter 1-15,17.
Sean Eddy: What is dynamic programming?, 2004. Nature Biotechnology, 22, 909-911. Fulltekst. All lecture handouts, all exercises and both partial examsDato | Undervises av | Sted | Tema | Kommentarer / ressurser |
24.08.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Introduksjon? | ? |
31.08.2011 | Anja Br?then Kristoffersen? | ? | Parvis sammenstilling? | Kap. 3 og "What is dynamic programming?"? |
07.09.2011 | Anja Br?then Kristoffersen ? | ? | Scoringmatriser og heuristiske sammenstillingsprogrammer ? | Kap 3 og 4? |
14.09.2011 | Anja Br?then Kristoffersen? | ? | Multippel sammenstilling? | Kap 5? |
21.09.2011 | Anja Br?then Kristoffersen? | ? | Profiler og HMM? | Kap 6 og 7? |
28.09.2011 | Anja Br?then Kristoffersen? | ? | Genprediksjon? | Kap 8 og 9? |
05.10.2011 | ? | ? | Ingen undervisning (h?stferie)? | ? |
12.10.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Transkripsjon? | Kap 18. Det blir gruppe?ving denne uken. Forelesningen starter 10.15 med 15 minutter om gens?k f?rst.? |
19.10.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Mikromatriser (1) ? | Kap 18. Hel-genom m?ling av transkripsjon? |
26.10.2011 | Jon K. L?rdahl ? | ? | Proteinstruktur 1? | kap 12-15? |
02.11.2011 | Jon K. L?rdahl ? | ? | Proteinstruktur 2? | kap 12-15? |
09.11.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Mikromatriser (2)? | Kap 18. Gjennomf?ring og analyse av mikromatrisefors?k. Bruk av mikromatriser til ? m?le genomisk kopitall. Analyse av kopitalldata.? |
16.11.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Analyser av SNP data? | ? |
23.11.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Fylogenetiske analyser? | ? |
30.11.2011 | Ole Christian Lingj?rde? | ? | Oppsummering? | ? |