KJM5631 – Multi-skala molekylmodellering
Kort om emnet
Emnet skal gi studenter i kjemi og tilgrensende fagomr?der innf?ring i molekylmodellering til bruk i kjemien. Det legges stor vekt p? praktisk anvendelse. Samtidig skal studentene f? god forst?else av metodene, ogs? utover det rent operasjonelle. M?let er ? gi studentene grunnlag for selvstendighet ? vurdere valg av metoder og p?liteligheten av resultatene.
Hva l?rer du?
Etter ? ha fullf?rt emnet kan du
- Forklare den teoretiske sammenhengen mellom statistisk mekanikk, kvantemekanikk og datamodellering.
- Forklare hvordan makroskopiske termodynamiske st?rrelser, inkludert frienergiprofiler og reaksjonshastigheter, kan utledes fra mikroskopiske mekaniske egenskaper.
- Beskrive hvordan molekyl?re modeller i ulike skalaer og oppl?sninger kan brukes til ? beskrive ulike (bio)kjemiske og (bio)fysiske fenomener.
- Beskrive og bruke de grunnleggende algoritmene som brukes i molekylmodellering, inkludert molekyldynamikk, samt mer avanserte forbedrede pr?vetakingsteknikker.
- Diskutere styrker og svakheter ved forskjellige modeller, inkludert ab initio, molekylmekanikk, QM/MM, grovkornede modeller og mesoskalamodeller.
- Vurdere n?yaktigheten av utf?rte beregninger.
- Presentere resultater fra beregningsstudier i b?de muntlig og skriftlig form.
Opptak til emnet
Studenter tatt opp til andre masterprogrammer kan, etter s?knad, f? adgang til emnet hvis dette er klarert med eget program.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke om opptak til v?re?studieprogrammer, eller s?ke om ??bli enkeltemnestudent.
Anbefalte forkunnskaper
KJM2601 – Fysikalsk kjemi II - kvantekjemi og spektroskopi, KJM3300 – Fysikalsk kjemi II (nedlagt), MAT1050 – Matematikk for anvendelser 1, MAT1060 – Matematikk for anvendelser 2, IN-KJM1900 – Introduksjon i programmering for kjemikere eller tilsvarende emner.
Undervisning
Emnet g?r over et semester. Undervisningen best?r av:
- 30 timer forelesninger og
- 32 timer datalab (?tte ?velser/rapporter).
For ? g? opp til eksamen?m? du ha f?tt godkjent samtlige ?tte rapporter. En av ?velsene skal du i tillegg presentere muntlig. Presentasjonen m? v?re godkjent.
Godkjente presentasjoner og rapporter er bare gyldig det semesteret de blir godkjent.
Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning og f?rste gruppetime (gjelder ogs? hvis du st?r p? venteliste). Du mister plassen p? emnet dersom gyldig forfall til f?rste forelesning/gruppetime ikke er meldt til Kjemisk institutt, f?r forelesningen/gruppen starter.
Eksamen
- Tre skriftlige deleksamener i form av innleveringsoppgaver teller tilsammen 50 % av avsluttende vurdering. Du f?r beskjed i starten av semesteret hvilke rapporter som teller med i vurderingen.
- Avsluttende muntlig eksamen teller 50 % ved sensurering.
Dette emnet har obligatoriske ?velser som m? v?re godkjent f?r avsluttende eksamen
Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emne: KJM9631 – Multi-skala molekylmodellering
Karakterskala
Emnet bruker?karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om?karakterskalaen
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Studenter som dokumenterer gyldig frav?r fra ordin?r eksamen, kan ta?utsatt eksamen i starten av neste semester.
Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordin?r eksamen, eller som ikke har best?tt.
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Tilrettelegging p? eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk p? eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen p? nytt
- Fusk/fors?k p? fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.